RNDr. Daniel Růžek, Ph.D.

2005-2008: Ph.D. (Molekulární a buněčná biologie a genetika) Akademie věd ČR, Parazitologický ústav a Jihočeská univerzita v Českých Budějovicících, Přírodovědecká fakulta
2007: RNDr. (Klinická biologie) Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Biologická fakulta
2003-2005: Mgr. (Klinická biologie; absolvováno s vyznamenáním) Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Biologická fakulta
2000-2003: Bc. (Biologie – Biomedicínská laboratorní technika) Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Biologická fakulta
2000: maturitní zkouška (český jazyk, německý jazyk, biologie, chemie; absolvováno s vyznamenáním), Gymnázium Český Krumlov, šestiletá forma studia

Postgraduální kurzy

2012: Institut postgraduálního vzdělávání ve zdravotnictví, Praha, Odborné zdravotnické laboratorní metody (akreditovaný kvalifikační kurz)
2011: British Society for Immunology Summer School 2011, Atlantic College, St. Donat’s Castle, Wales, Velká Británie (postgraduální kurz)
2011: Société de Pathologie Infectieuse de Langue Française, Grenoble, Francie: “Acute Infectious Encephalitis” (postgraduální kurz)
2010: Rollins School of Public Health, Emory University, Atlanta, USA: “BSL-4 Science and Safety” (postgraduální kvalifikační kurz)

Zaměstnání

2011-dosud: samostatný vědecký pracovník, Parazitologický ústav BCAVČR
2009-2011: vědecký pracovník-postdoktorand, Parazitologický ústav BCAVČR
2008-2009: vědecký pracovník-postdoktorand, Texas Biomedical Research Institute, Department of Virology and Immunology, San Antonio, Texas, USA
2008-dosud: odborný asistent v oboru lékařská virologie, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicících, Přírodovědecká fakulta, Katedra medicínské biologie
2005-2009: odborný pracovník výzkumu a vývoje, Parazitologický ústav BC AVČR
2006-2008: asistent v oboru lékařská virologie, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Biologická fakulta, Katedra medicínské biologie
2004-2006: asistent, Biologická fakulta Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích, Biologická fakulta, Katedra obecné biologie

Zahraniční studijní a výzkumné pobyty

2011 (2 týdny): Laboratory of Neurovirology and Inflammation Biology, Centre for Cellular and Molecular Biology, Hyderabad, Indie
2008-2009 (1 rok): Department of Virology and Immunology, Texas Biomedical Research Institute, San Antonio, USA
2008 (2 týdny): Laboratoire de Physiopathologie de la Barriere Hemato-Encephalique, Faculté des Sciences Jean Perrin, Université d’Artois, Lens, Francie
2006 (2 týdny): Royal (Dick) School of Veterinary Studies, Centre for Tropical Veterinary Medicine, University of Edinburgh, Velká Británie

Členství v profesních organizacích

Člen Světové akademie věd, inženýrství a technologie (World Academy of Science, Engineering, and Technology, WASET)
Člen Mezinárodní vědecké skupiny pro klíšťovou encefalitidu (Vídeň)
Člen Československé společnosti mikrobiologické
Člen redakční rady (Editorial Board Member): World Journal of Virology (od r. 2010)
Předseda Etické komise Parazitologického ústavu AVČR (od r. 2011)
Recenzent pro řadu zahraničních časopisů (Virology, Vector-Borne and Zoonotic Diseases, Expert Reviews on Antimicrobial Therapy, Journal of Virological Methods, Current Microbiology, European Journal of Neurology, Journal of Clinical Virology, Viral Immunology, Intervirology, World Journal of Pediatrics, Journal of Internal Medicine a další)

Certifikáty

Oprávnění pro řízení a kontrolu experimentů s laboratorními zvířaty v ČR (licence č. V/5/2005/24)
Oprávnění pro provádění experimentů s laboratorními zvířaty v USA (SFBR IACUC Exam No. 1599743)
Certifikát o absolvování kurzu “real-time PCR” (Applied Biosystems, Praha 2010)
Osvědčení k výkonu zdravotnického povolání v oboru Odborný pracovník v laboratorních metodách a v přípravě léčivých přípravků (2012)

Ocenění

2006: 1. místo, Studentská vědecká soutěž, Studentská grantová agentura, České Budějovice
2006: cestovní grant pro mladé vědce, Europen Society for Clinical Virology, Birmingham, Velká Británie
2009: cena děkana za vynikající vědecké výsledky presentované v disertační práci, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
2009: Sinneckerova-Kunzova cena (Herbert Sinnecker-Christian Kunz Award) za výzkum na poli klíšťaty přenášených nemocí, Výmar, Německo
2011: cestovní grant pro mladé lékaře a vědce, Société de Pathologie Infectieuse de Langue Française, Francie

Jiná ocenění

2009 Plaketa města Vyšší Brod

Přehled publikační činnosti:

Monografie

Růžek, D. (editor): Flavivirus Encephalitis. InTech Publ., Rijeka. Hard cover, 478 pages (ISBN: 978-953-307-669-0)

v produkci:

Singh, S.K. & Růžek, D. (editors): Neuroviral Infections. Taylor and Francis CRC Publ., Florida. v produkci (ISBN: 143-986-852-2)
Singh, S.K. & Růžek, D. (editors): Viral hemorrhagic fevers. Taylor and Francis CRC Publ., Florida. v produkci (ISBN: 143-988-429-3)

Kapitoly v knihách

Růžek, D., Tkachev, S.E., Yakimenko, V.V., Karan, L.S., Grubhoffer, L. Omsk hemorrhagic fever virus. In: Molecular detection of human viral pathogens, edited by: D. Liu; Taylor and Francis CRC Publ., Florida, USA,231-239.
Donoso Mantke, O., Karan, L.S., Růžek, D. Tick-borne encephalitis viruses: a general overview. In: Flavivirus Encephalitis, edited by: Daniel Růžek; InTech, Rijeka,133-156.

Publikace v recenzovaných časopisech

Růžek, D., Štěrba, J., Kopecký, J., Grubhoffer, L. (2006). The supposedly attenuated hy-HK variant of highly virulent Hypr strain of tick-borne encephalitis virus is obviously a strain of Langat virus. Acta Virologica 50:277-278. [IF=0.746]
Růžek, D., Šťastná, H., Kopecký, J., Golovljova, I., Grubhoffer, L. (2007). Rapid subtyping of tick-borne encephalitis virus isolates using multiplex RT-PCR. Journal of Virological Methods 144:133-137. [IF=2.133]
Růžek, D., Piskunova, N., Žampachová, E. (2007). High variability in viral load in cerebrospinal fluid from patients with herpes simplex and varicella-zoster infections of the central nervous system. Clinical Microbiology and Infection 13:1217-1219. [IF=4.014]
Růžek, D., Gritsun, T.S., Forrester, N.L., Gould, E.A., Kopecký, J., Golovchenko, M., Rudenko, N., Grubhoffer, L. (2008). Mutations in the NS2B and NS3 genes affect mouse neuroinvasiveness of a Western European field strain of tick-borne encephalitis virus. Virology 10:249-255. [IF=3.042]
Rudenko, N., Golovchenko, M., Mokráček, A., Piskunova, N., Růžek, D., Mallátová, N., Grubhoffer, L. (2008). Detection of Borrelia bissettii in cardiac valve tissue of a patient with endocarditis and aortic valve stenosis (Czech Republic). Journal of Clinical Microbiology 46:3540-3543. [IF=4.162]
Růžek, D., Bell-Sakyi, L., Kopecký, J., Grubhoffer, L. (2008). Growth of tick-borne encephalitis virus (European subtype) in cell lines from vector and non-vector ticks. Virus Research 137:142-146. [IF=2.563]
Růžek, D., Salát, J., Palus, M., Gritsun,T.S., Gould, E.A., Dyková, I., Skallová, A., Jelínek, J., Kopecký, J., Grubhoffer, L. (2009). CD8+ T-cells mediate immunopathology in tick-borne encephalitis. Virology 384:1-6. [IF=3.042]
Rudenko, N., Golovchenko, M., Růžek, D., Piskunova, N., Mallátová, N., Grubhoffer, L. (2009). Molecular detection of Borrelia bissettii DNA in serum samples from patients in the Czech Republic with suspected borreliosis. FEMS Microbiology Letters 292: 274-281. [IF=2.199]
Bell-Sakyi, L., Růžek, D., Gould, E.A. (2009). Cell lines from the soft tick Ornithodoros moubata. Experimental and Applied Acarology 49: 209-219. [IF=1.391]
Růžek, D., Vancová, M., Tesařová, M., Ahantarig, A., Kopecký, J., Grubhoffer, L. (2009). Morphological changes in human neural cells following tick-borne encephalitis virus infection. Journal of General Virology 90: 1649-1658. [IF=3.260]
Ahantarig, A., Růžek, D., Vancová, M., Janowitz, A., Šťastná, H., Tesařová, M., Grubhoffer, L. (2009). Tick-borne encephalitis virus infection of cultured mouse macrophages. Intervirology 52: 283-290. [IF=1.106]
Kilian, P., Růžek, D., Danielová, V., Hypša, V. Grubhoffer, L. (2010). Nucleotide variability of Ťahyňa virus (Bunyaviridae, Bunyavirus) small (S) and medium (M) genomic segments in field strains differing in biological properties. Virus Research 149: 119-123. [IF=2.563]
Růžek, D., Dobler, G., Donoso Mantke, O. (2010). Tick-borne encephalitis; pathogenesis and clinical implications. Travel Medicine and Infectious Diseases, 8(4):223-232.
Růžek, D.,Yakimenko, V.V., Karan, L.S., Tkachev, S.E. (2010). Omsk haemorrhagic fever. The Lancet 376(9758):2104-13. [IF=30.758]
Unni, S.K., Růžek, D., Chhatbar, H., Mishra, R., Johri, M.K., Singh, S.K. (2011). Japanese encephalitis virus: from genome to infectome. Microbes and Infection, 13(4):312-21. [IF=2.757]
Gäumann, R., Růžek, D., Mühlemann, K., Strasser, M., Beuret, C.M. (2011). Phylogenetic and virulence analysis of tick-borne encephalitis virus field isolates from Switzerland. Journal of Medical Virology, 83(5):853-63. [IF=2.470]
Chrudimská, T., Slaninová, J., Růžek, D., Rudenko, N., Grubhoffer, L. (2011) Functional characterization of two defensin isoforms of the hard tick Ixodes ricinus. Parasites and Vectors,4:63. [IF=2.050]
Achazi, K., Růžek, D., Donoso-Mantke, O., Schlegel, M., Sheikh, A.H., Wenk, M., Schmit-Chanasit, J., Ohlmeyer, L., Rühe, F., Vor, T., Kiffner, C., Kallies, R., Ulrich, R., Niedrig, M. (2011) Rodents as Sentinels for the Prevalence of Tick-Borne Encephalitis Virus. Vector-Borne and Zoonotic Diseases, 11(6):641-7. [IF=2.607]
Weidmann, M., Růžek, D., Křivanec, K., Zöller, G., Essbauer, S., Pfeffer, M., de A. Zanotto, P.M., Hufert, F., Dobler, G. (2011) Relation of genetic phylogeny and geographical distance of tick-borne encephalitis virus in Central Europe. Journal of General Virology, 92(Pt 8):1906-16. [IF=3.260]
Růžek, D., Salát, J., Singh, S.K., Kopecký, J. (2011) Breakdown of the blood-brain barrier during tick-borne encephalitis in mice is not mediated by CD8+ T-cells. PLoS One, 6(5):e20472. [IF=4.351]
Calzolari, M., Zé-Zé, M., Růžek, D., Vázquez, A., Jeffries, C., Defilippo, F., Costa Osório, H., Kilian, P., Ruíz, S., Fooks, A.R., Maioli, G., Amaro, F., Tlustý, M., Figuerola, J., Medlock, J.M., Bonilauri, P., João Alves, M., Šebesta, O., Tenorio, A., Vaux, A.G.C., Bellini, R., Gelbič, I., Sánchez-Seco, M.P., Johnson, N., Dottori, M. (2012) Detections of mosquito-only flaviviruses in Europe. Journal of General Virology, in press. [IF=3.260]
Chaudhuri, A., Růžek, D. (2012) First Documented Case of Imported Tick-borne Encephalitis in Australia. Internal Medicine Journal, in press [IF=1.626]

Přehled pedagogické činnosti

garant předmětu Lékařská virologie na Přírodovědecké fakultě Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích (od roku 2006).
garant předmětu “Virology” v rámci společného přeshraničního oboru Biological Chemistry mezi Jihočeskou univerzitou a Univerzitou Jana Keplera v Linci (od roku 2012).
výuka v rámci dalších předmětů: Vakcíny proti nemocem přenášeným klíšťaty I až IV; Diagnostika chorob přenášených vektory I až IV na Přírodovědecké fakultě Jihočeské univerzity.
vedoucí či konzultant jedenácti bakalářských a diplomových prací, z toho dvě jsou aktuální
vedoucí práce Středoškolské odborné činnosti v rámci projektu Otevřená věda, Akademie věd ČR (2010)
školitel dvou doktorandů

Granty

2006: GAJU 35/2005/P-BF Studium potenciálních molekulárních determinant virulence viru klíšťové encefalitidy (řešitel)
2007: GAJU 44/2006/P-BF Molekulární neuropatogeneze klíšťové encefalitidy (řešitel)
2007: FRVŠ 230 Vývoj subtypově-specifické metody real-time RT-PCR pro detekci viru klíšťové encefalitidy (řešitel)
2008-2011: MO ČR OVUVZU2008002 - HOREČKA - Metoda rychlé detekce a identifikace původců virových hemoragických horeček (spoluřešitel)
2010-2012: GAČR P302/10/P438 Role hematoencefalické bariéry v neuropatogenezi klíšťové encefalitidy (řešitel)
2011-2015: GAČR P502/11/2116 Rozdíly v klinickém průběhu klíšťové encefalitidy u hostitele a jejich genetická determinace (řešitel)

Přednášky na konferencích a seminářích

2011 Centre for Cellular and Molecular Biology, Hyderabad, Indie (zvaná přednáška)
2011 Seminář: Klíšťová encefalitida a jiné infekce přenášené klíšťaty, Lékařský dům, Praha (zvaná přednáška)
2010 1st World Congress on Virus and Infections, Busan, Jižní Korea (zvaná přednáška)
2010 ArboZooNet Meeting, Ribát, Maroko (zvaná přednáška)
2010 25. kongres Československé společnosti mikrobiologické, Stará Lesná, Slovensko
2009 International Summer School “Pathogen-Host-Interplay”, Humboldt Universität zu Berlin, Berlín, Německo (zvaná přednáška)
2009 NIH+CDC Conference on Emerging and Re-emerging Diseases in Central and Eastern Europe, Sofie, Bulharsko (zvaná přednáška)
2009 X. International Jena Symposium on Tick-borne Diseases, Výmar, Německo
2008 Université d’Artois, Lens, Francie (zvaná přednáška)
2008 Federální úřad pro civilní ochranu, Spiez Laboratory, Spiez, Švýcarsko (zvaná přednáška)
2008 Seminář : Epidemiologie vybraných parazitárních nákaz, Lékařský dům, Praha (zvaná přednáška)
2007 24. kongres Československé společnosti mikrobiologické, Liberec
2007 Jihočeská klíšťata a klíšťová encefalitida, konference Krajského úřadu JčK, Jihočeské univerzity a Biologického centra AV ČR v Českých Budějovicích, Krajský úřad, České Budějovice
2007 Robert Koch-Institut, Berlín, Německo (zvaná přednáška)
2005 Zoonózy, ich pôvodcovia a vektory, Smolenice, Slovensko.
2005 RNA Club, České Budějovice

Pracovníci > RNDr. Daniel Růžek, Ph.D.

Sbírky

Pro porovnávací studie jsou helmintologům z různých zemí k dispozici rozsáhlé sbírky...

RNDr. Daniel Růžek, Ph.D.

Kontakt

Výzkumné zaměření

Výuka

Současné publikace

Odborný životopis

Vzdělání

Postgraduální kurzy

Zaměstnání

Zahraniční studijní a výzkumné pobyty

Členství v profesních organizacích

Certifikáty

Ocenění

Jiná ocenění

Přehled publikační činnosti:

Monografie

Kapitoly v knihách

Publikace v recenzovaných časopisech

Přehled pedagogické činnosti

Granty

Přednášky na konferencích a seminářích

Seznam pracovníků