RNDr. Martina Lisnerová, Ph.D.
Maiden:Jedličková
Job Position: Postdoc - Laboratory of Fish Protistology
Phone:
+420 38777 5450
E-mail:
jedlickovamarti@seznam.cz
Room:
113
Education:
2017–2022: Ph.D. in Parasitology, Faculty of Science, University of South Bohemia
2022: Rigorous Examination
2015–2017: M.Sc. in Parasitology, Faculty of Science, University of South Bohemia
2012–2015: B.Sc. in Biology, Faculty of Science, University of South Bohemia
2008–2012: Gymnasium, Plzeň
Summary of Expertise:
- Field collections of environmental samples (water, sediment), freshwater and marine invertebrates, sample collection planning, vertebrate dissections, tissue sampling
- Identification of fish parasites using light microscopy; preparation of histological and permanent slides. Preparation of samples for scanning electron microscopy, measurement of morphological characteristics, species descriptions
- Molecular methods: DNA isolation, PCR, metabarcoding, gel isolation, library preparation for Illumina or Oxford nanopore sequencing
- Bioinformatic analyses: Bioinformatic analysis of metabarcoding data (e.g., DADA2 package in R, Linux system using Python scripts), phylogenetic analyses (e.g., MAFFT, RAxML, MrBayes), statistical data processing (basic knowledge in R; e.g., alfa, beta-diversity determination, character mapping onto phylogenetic trees, calculation of phylogenetic signal within identified characters, coevolutionary relationships, co-occurrence networks, etc.)
Education:
2017–2022: v oboru Parazitologie, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita
2022: RNDr.
2015–2017: M.Sc. v oboru Parazitologie, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita
2012–2015: B.Sc.v oboru Parazitologie, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita
2008–2012: Gymnázium, Plzeň
Summary of Expertise:
- Terénní odběry vzorků životního prostředí (voda, sediment), sladkovodní a mořští bezobratlí, plánování odběru vzorků, pitvy obratlovců, odběr vzorků tkání
- Identifikace rybích parazitů pomocí světelné mikroskopie; příprava histologických a trvalých preparátů. Příprava vzorků pro skenovací elektronovou mikroskopii, měření morfologických charakteristik, druhové popisy
- Molekulární metody: izolace DNA, PCR, metabarcoding, izolace gelu, příprava knihoven pro NGS sekvenování
- Bioinformatické analýzy: Bioinformatická analýza dat metabarcodingu (např. balíček DADA2 v R, systém Linux pomocí skriptů Python), fylogenetické analýzy (např. MAFFT, RAxML, MrBayes), statistické zpracování dat (základní znalosti v R; např. stanovení alfa a beta diverzity, mapování znaků na fylogenetické stromy, koevoluční vztahy, co-occurrence networks atd.)
| Total found: 13 records
|
|---|
|
Rossin M.A., Cantatore D.M.P., Lisnerová M., Taglioretti V. (2024) Henneguya (Cnidaria: Myxobolidae) species infecting Oligosarcus jenynsii (Characiformes: Characidae) in a Neotropical shallow lake from Argentina: morphological and molecular characterisation Folia Parasitologica
71
: 005. DOI: 10.14411/fp.2024.005 |
|
Lisnerová M.,
Holzer A., Blabolil P.,
Fiala I. (2023) Evaluation and optimization of an eDNA metabarcoding assay for detection of freshwater myxozoan communities Environmental DNA
5
: 312–325. DOI: 10.1002/edn3.380 |
|
Lisnerová M., Lisner A., Cantatore D., Schaeffner B.,
Pecková H., Tyml T.,
Fiala I.,
Bartošová-Sojková P.,
Holzer A. (2022) Correlated evolution of fish host length and parasite spore size: a tale from myxosporeans inhabiting elasmobranchs International Journal for Parasitology
52
: 97–110. DOI: 10.1016/j.ijpara.2021.05.008 |
|
Lisnerová M.,
Martínek I.,
Alama Bermejo G., Bouberlová K., Schaeffner B., Nkabi N.,
Holzer A.,
Bartošová-Sojková P. (2022) An ancient alliance: Matching evolutionary patterns of cartilaginous fishes (Elasmobranchii) and chloromyxid parasites (Myxozoa) Infection Genetics and Evolution
103
: 105346. DOI: 10.1016/j.meegid.2022.105346 |
|
Blabolil P., Hänfling B., Harper L.R., Sellers G., Di Muri C., Griffiths N.P., Dos Santos R.A., Kneževic-Jaric J., Jůza T., Vašek M., Čech M., Muška M., Fiala , Lisnerová M., Peterka J. (2021) Vzorkování volné genetické informace (eDNA) z vody. [Sampling of free genetic information (eDNA) from water.] Ověřená technologie
44. |
|
Cavaleiro B., Serrao J., Nogueira S., Ribeiro L., Hermida M., Cruz C., Lisnerová M.,
Fiala I., Saraiva A. (2021) Survey of Kudoa spp. (Myxozoa, Cnidaria) in fishes from the Madeira Archipelago and the Portuguese mainland coast: detection of Kudoa thyrsites in new hosts Scomber colias and Micromesistius poutassou Folia Parasitologica
68
: 317. DOI: 10.14411/fp.2021.003 |
|
Blabolil P., Hänfling B., Harper L.R., Sellers G., Di Muri C., Knežević Jarić J., Jůza T., Vašek M., Sajdlová Z., Čech M., Šmejkal M., Muška M., Fiala , Lisnerová M., Peterka J. (2020) Environmentální DNA metabarkóding vody [Environmantal DNA water metabarcoding] Holubová, M. & Blabolil, P. (eds.) Sborník abstraktů z XVII. České rybářské a ichtyologické konference, České Budějovice, Biologické Centrum AV ČR, v.v.i.
19-25. |
|
Blabolil P., Sajdlová Z., Knežević Jarić J., Jůza T., Vašek M., Čech M., Šmejkal M., Muška M., Říha M., Kubečka J., Fiala , Lisnerová M., Peterka J. (2020) Další střípek do mozaiky poznání rybích společenstev. [Another piece of mosaic knowledge of fish communities.] Rybářství
11
: 40-45. |
|
Lisnerová M., Blabolil P.,
Holzer A., Jurajda P.,
Fiala I. (2020) Myxozoan hidden diversity: the case of Myxobolus pseudodispar Gorbunova, 1936 Folia Parasitologica
67
: 019. DOI: 10.14411/fp.2020.019 |
|
Lisnerová M.,
Fiala I., Cantatore D., Irigoitia M., Timi J.,
Pecková H.,
Bartošová-Sojková P., Sandoval C.M., Luer C., Morris J.,
Holzer A. (2020) Mechanisms and Drivers for the Establishment of Life Cycle Complexity in Myxozoan Parasites Biology
9
: 10. DOI: 10.3390/biology9010010 |
|
Korytář T., Wiegertjes G.F., Zusková E., Tomanová A., Lisnerová M.,
Patra S., Sieranski V.,
Šíma R.,
Born-Torrijos A., Wentzel A.S., Blasco-Monleon S., Yanes-Roca C., Policar T.,
Holzer A. (2019) The kinetics of cellular and humoral immune responses of common carp to presporogonic development of the myxozoan Sphaerospora molnari Parasites & Vectors
12
: 208. DOI: 10.1186/s13071-019-3462-3 |
|
Bartošová-Sojková P.,
Lövy A., Reed C., Lisnerová M., Tomková T.,
Holzer A.,
Fiala I. (2018) Life in a rock pool: Radiation and population genetics of myxozoan parasites in hosts inhabiting restricted spaces PLOS ONE
13
: e0194042. DOI: 10.1371/journal.pone.0194042 |
|
Tyml T., Lisnerová M.,
Kostka M.,
Dyková I. (2018) Current view on phylogeny within the genus Flabellula Schaeffer, 1926 (Amoebozoa: Leptomyxida) European Journal of Protistology
64
: 40–53. DOI: 10.1016/j.ejop.2018.03.005 |
