prof. Ing. Miroslav Oborník, Ph.D.

Funkce: Vedoucí laboratoře - Laboratoř evoluční protistologie

Kontaktní údaje

Telefon: +420 387775464
E-mail: obornik@paru.cas.cz
Místnost: 236

Popis

Výzkumné zaměření

Evoluce prvoků a řas s nimi příbuzných.

Odborný životopis

Informace v anglické verzi.

Výuka Introduction to Bioinformatics
Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity / Faculty of Science, University of South Bohemia

Introduction to Bioinformatics exercises
Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity / Faculty of Science, University of South Bohemia

Molekulární taxonomie / Molecular Taxonomy
Zemědělská fakulta Jihočeské univerzity / Faculty of Agriculture, University of South Bohemia

Publikace
Celkem nalezeno: 72 záznamů
Füssy Z., Masařová P., Kručinská J., Esson H. J., Oborník M. (2017) Budding of the alveolate alga Vitrella brassicaformis resembles sexual and asexual processes in apicomplexan parasites Protist 168 : 80-91.
DOI: 10.1016/j.protis.2016.12.001
Füssy Z., Oborník M. (2017) Reductive Evolution of Apicomplexan Parasites from Phototrophic Ancestors. In: Pontarotti P. (Ed.), Evolutionary Biology: Self/Nonself Evolution, Species and Complex Traits Evolution, Methods and Concepts. Springer, Cham 217-236.
DOI: 10.1007/978-3-319-61569-1_12
Füssy Z., Oborník M. (2017) Chromerids and their plastids Advances in Botanical Research 84 : 187-218.
DOI: 10.1016/bs.abr.2017.07.001
Sobotka R., Esson H. J., Koník P., Trsková E., Moravcová L., Horák A., Dufková P., Oborník M. (2017) Extensive gain and loss of photosystem I subunits in chromerid algae, photosynthetic relatives of apicomplexans Scientific Reports 7 : 13214.
Tomčala A., Kyselová V., Schneedorferová I., Opekarová I., Moos M., Urajová P., Kručinská J., Oborník M. (2017) Separation and identification of lipids in the photosynthetic cousins of Apicomplexa Chromera velia and Vitrella brassicaformis. Journal of Separation Science 40 : 3402-3413.
DOI: 10.1002/jssc.201700171
Votýpka J., Modrý D., Oborník M., Šlapeta J., Lukeš J. (2017) Apicomplexa. In: J.M. Archibald, A.G.B. Simpson and C.H. Slamovits (Eds.), Handbook of the Protists Springer 1-58.
DOI: 10.1007/978-3-319-32669-6_20-1
Cihlář J., Füssy Z., Horák A., Oborník M. (2016) Evolution of the Tetrapyrrole Biosynthetic Pathway in Secondary Algae: Conservation, Redundancy and Replacement PLoS ONE 11 : e0166338.
DOI: 10.1371/journal.pone.0166338
Oborník M., Kručinská J., Esson H. J. (2016) Life cycles of chromerids resemble those of colpodellids and apicomplexan parasites Perspectives in Phycology 3 : 21-27.
DOI: 10.1127/pip/2016/0038
Záhonová K., Füssy Z., Oborník M., Eliáš M., Yurchenko V. (2016) RuBisCO in Non-Photosynthetic Alga Euglena longa: Divergent Features, Transcriptomic Analysis and Regulation of Complex Formation PLoS ONE 11 : e0158790.
DOI: 10.1371/journal.pone.0158790

Dokumenty ke stažení:
Zahonova et al. 2016 PloS ONE (pdf)
Borovička J., Oborník M., Stříbrný J., Noordeloos M., Parra Sánchez L., Gryndler M. (2015) Phylogenetic and chemical studies in the potential psychotropic species complex of Psilocybe atrobrunnea with taxonomic and nomenclatoral notes Persoonia 34 : 11-13.
DOI: 10.3767/003158515X685283
Doležalová J., Oborník M., Hajdušková E., Jirků M., Petrželková K., Bolechová P., Cutillas C., Callejón R., Jaroš J., Beránková Z., Modrý D. (2015) How many species of whipworms do we share? Whipworms from man and other primates form two phylogenetic lineages Folia Parasitologica 62 : 063.
DOI: 10.14411/fp.2015.063

Dokumenty ke stažení:
Dolezalova et al FP 2015 (pdf)
Flegontov P., Michálek J., Janouškovec J., Lai H., Jirků M., Hajdušková E., Tomčala A., Otto T., Keeling P., Pain A., Oborník M., Lukeš J. (2015) Divergent Mitochondrial Respiratory Chains in Phototrophic Relatives of Apicomplexan Parasites. Molecular Biology and Evolution 32 : 1115-1131.
DOI: 10.1093/molbev/msv021

Dokumenty ke stažení:
Flegontov et al. 2015 MBE (pdf)
Koblížek M., Moulisová V., Muroňová M., Oborník M. (2015) Horizontal transfers of two types of puf operons among phototrophic members of the Roseobacter clade Folia Microbiologica 60 : 37-43.
DOI: 10.1007/s12223-014-0337-z
Oborník M., Lukeš J. (2015) The Organellar Genomes of Chromera and Vitrella, the Phototrophic Relatives of Apicomplexan Parasites Annual review of microbiology 69 : 129-144.
DOI: 10.1146/annurev-micro-091014-104449

Dokumenty ke stažení:
Obornik,Lukes_2015 (pdf)
Ševčíková T., Horák A., Klimeš V., Zbránková V., Demir-Hilton E., Sudek S., Jenkins J., Schmutz J., Přibyl P., Vlček Č., Lang B., Oborník M., Worden A., Eliáš M. (2015) Updating algal evolutionary relationships through plastid genome sequencing: did alveolate plastids emerge through endosymbiosis of an ochrophyte? Scientific Reports 5 : 10134.
DOI: 10.1038/srep10134
Woo Y., Ansari H., Otto T., Klinger C., Kolísko M., Michálek J., Saxena A., Shanmugam D., Tayyrov A., Veluchamy A., Ali S., Bernal A., Del C., Cihlář J., Flegontov P., Gornik S., Hajdušková E., Horák A., Janouškovec J., Katris N., Mast F., Miranda-Saavedra D., Mourier T., Naeem R., Nair M., Panigrahi A., Rawlings N., Regelado E., Ramaprasad A., Samad N., Tomčala A., Wilkes J., Neafsey D., Doerig C., Bowler C., Keeling P., Roos D., Dacks J., Templeton T., Waller R., Lukeš J., Oborník M., Pain A. (2015) "Chromerid genomes reveal the evolutionary path from photosynthetic algae to obligate intracellular parasites " eLife 4 : e06974.
DOI: 10.7554/eLife.06974

Dokumenty ke stažení:
Woo_et_al_eLife_2015 (pdf)
Zíková A., Oborník M., Lukeš J. (2015) Fancy a gene? A surprisingly complex evolutionary history of peroxiredoxins. Microbial Cell 2 : 5-13.
DOI: 10.15698/mic2015.02.189

Dokumenty ke stažení:
Zikova et al. 2015 (pdf)
Gallusová M., Qablan M., D’amico G., Oborník M., Petrželková K., Mihalca A., Modrý D. (2014) Piroplasms in feral and domestic equines in rural areas of the Danube Delta, Romania, with survey of dogs as a possible reservoir Veterinary Parasitology 206 : 287-292.
DOI: 10.1016/j.vetpar.2014.10.018
Hyliš M., Oborník M., Nebesářová J., Vávra J. (2013) Description and phylogeny of Zelenkaia trichopterae gen. et sp. nov. (Microsporidia), an aquatic microsporidian parasite of caddisflies (Trichoptera) forming spore doublets. Journal of Invertebrate Pathology 114 : 11-21.
DOI: 10.1016/j.jip.2013.04.010
Janouškovec J., Sobotka R., Lai D., Flegontov P., Koník P., Komenda J., Ali S., Prášil O., Pain A., Oborník M., Lukeš J., Keeling P. (2013) Split photosystem protein, linear-mapping topology and growth of structural complexity in the plastid genome of Chromera velia Molecular Biology and Evolution 30 : 2447-2462.
DOI: 10.1093/molbev/mst144

Dokumenty ke stažení:
Janouskovec-MBE-2013 (pdf)

Více publikací

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Parazitologický ústav
Branišovská 1160/31
370 05 České Budějovice

NAJÍT PRACOVNÍKA