Mgr. Aleš Horák, Ph.D.

Funkce: Vedoucí laboratoře - Laboratoř environmentální genomiky

Kontaktní údaje

Telefon: +420 387775409
E-mail: ogar@paru.cas.cz
Místnost: PARU II

Odborný životopis

Více informací v anglické verzi.

Výuka Úvod do Bioinformatiky / Introduction to Bioinformatics
Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity / Faculty of Science University of South Bohemia

Úvod fo genomiky / Introduction to Genomics
Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity / Faculty of Science, University of South Bohemia

Publikace
Celkem nalezeno: 30 záznamů
Sobotka R., Esson H. J., Koník P., Trsková E., Moravcová L., Horák A., Dufková P., Oborník M. (2017) Extensive gain and loss of photosystem I subunits in chromerid algae, photosynthetic relatives of apicomplexans Scientific Reports 7 : 13214.
Cihlář J., Füssy Z., Horák A., Oborník M. (2016) Evolution of the Tetrapyrrole Biosynthetic Pathway in Secondary Algae: Conservation, Redundancy and Replacement PLoS ONE 11 : e0166338.
DOI: 10.1371/journal.pone.0166338
Flegontova O., Flegontov P., Malviya S., Audic S., Wincker P., de Vargas C., Bowler C., Lukeš J., Horák A. (2016) Extreme diversity of diplonemid eukaryotes in the ocean Current Biology 26 : 3060-3065.
DOI: 10.1016/j.cub.2016.09.031

Dokumenty ke stažení:
Flegontova et al. 2016 CB (pdf)
de Vargas C., Audic S., Henry N., Decelle J., Mahé F., Logares R., Lara E., Berney C., Le Bescot N., Probert I., Carmichael M., Poulain J., Romac S., Colin S., Aury J., Bittner L., Chaffron S., Dunthorn M., Engelen S., Flegontova O., Guidi L., Horák A., Jaillon O., Lima-Mendez G., Lukeš J., Malviya S., Morard R., Mulot M., Scalco E., Siano R., Vincent F., Zingone A., Dimier C., Picheral M., Searson S., Kandels-Lewis S., Coordinators T., Acinas S., Bork P., Bowler C., Gorsky G., Grimsley N., Hingamp P., Iudicone D., Not F., Ogata H., Pesant S., Raes J., Sieracki M., Speich S., Stemmann L., Sunagawa S., Weissenbach J., Wincker P., Karsenti E. (2015) Eukaryotic plankton diversity in the sunlit ocean Science 348 : 1261605.
DOI: 10.1126/science.1261605

Dokumenty ke stažení:
deVargas-et-al_Science_2015 (pdf)
Lukeš J., Flegontova O., Horák A. (2015) Diplonemids Current Biology 25 : R702-R704.
DOI: 10.1016/j.cub.2015.04.052

Dokumenty ke stažení:
Lukes,Flegontova,Horak_CB_2015 (pdf)
Ševčíková T., Horák A., Klimeš V., Zbránková V., Demir-Hilton E., Sudek S., Jenkins J., Schmutz J., Přibyl P., Vlček Č., Lang B., Oborník M., Worden A., Eliáš M. (2015) Updating algal evolutionary relationships through plastid genome sequencing: did alveolate plastids emerge through endosymbiosis of an ochrophyte? Scientific Reports 5 : 10134.
DOI: 10.1038/srep10134
Woo Y., Ansari H., Otto T., Klinger C., Kolísko M., Michálek J., Saxena A., Shanmugam D., Tayyrov A., Veluchamy A., Ali S., Bernal A., Del C., Cihlář J., Flegontov P., Gornik S., Hajdušková E., Horák A., Janouškovec J., Katris N., Mast F., Miranda-Saavedra D., Mourier T., Naeem R., Nair M., Panigrahi A., Rawlings N., Regelado E., Ramaprasad A., Samad N., Tomčala A., Wilkes J., Neafsey D., Doerig C., Bowler C., Keeling P., Roos D., Dacks J., Templeton T., Waller R., Lukeš J., Oborník M., Pain A. (2015) "Chromerid genomes reveal the evolutionary path from photosynthetic algae to obligate intracellular parasites " eLife 4 : e06974.
DOI: 10.7554/eLife.06974

Dokumenty ke stažení:
Woo_et_al_eLife_2015 (pdf)
Janouškovec J., Horák A., Barott K., Rohwer F., Keeling P. (2013) Environmental distribution of coral-associated relatives of apicomplexan parasites. ISME journal 7 : 444-447.
DOI: 10.1038/ismej.2012.129
Koblížek M., Zeng Y., Horák A., Oborník M. (2013) Regressive Evolution of Photosynthesis in the Roseobacter Clade. Advances in Botanical Research 66 : 385-405.
Pomajbíková K., Oborník M., Horák A., Petrželková K., Grim J., Levecke B., Todd A., Mulama M., Kiyang J., Modrý D. (2013) Novel Insights into the Genetic Diversity of Balantidium and Balantidium-like Cyst-forming Ciliates. PLOS Neglected Tropical Diseases 7 : e2140.
DOI: 10.1371/journal.pntd.0002140

Dokumenty ke stažení:
Pomajbikova_et_al_2013 (pdf)
Janouškovec J., Horák A., Barott K., Rohwer F., Keeling P. (2012) Global analysis of plastid diversity reveals apicomplexan-related lineages in coral reefs. Current Biology 22 : R518–R519.
DOI: 10.1016/j.cub.2012.04.047
Mikulíček P., Horák A., Zavadil V., Kautman J., Piálek J. (2012) Hybridization between three crested newt species (Triturus cristatus superspecies) in the Czech Republic and Slovakia: comparison of nuclear markers and mitochondrial DNA. Folia Zoologica 61 : 202–218.
Okamoto N., Horák A., Keeling P. (2012) Description of two species of early branching dinoflagellates, Psammosa pacifica n. g., n. sp. and P. atlantica n. sp. PLoS ONE 7 : e34900.
DOI: 10.1371/journal.pone.0034900
Valenčáková A., Bálent P., Ravaszová P., Horák A., Oborník M., Halánová M., Malčeková B., Novotný F., Goldová M. (2012) Molecular identification and genotyping of Microsporidia in selected hosts. Parasitology Research 110 : 689-693.
DOI: 10.1007/s00436-011-2543-9
Votýpka J., Klepetková H., Yurchenko V., Horák A., Lukeš J., Maslov D. (2012) Cosmopolitan distribution of a trypanosomatid Leptomonas pyrrhocoris. Protist 163 : 616-631.
DOI: 10.1016/j.protis.2011.12.004

Dokumenty ke stažení:
2012_Votypka_Protist_616 (pdf)
Allen A., Dupont C., Oborník M., Horák A., Nunes-Nesi A., Mccrow J., Zheng H., Johnson D., Hu H., Fernie A., Bowler C. (2011) Evolution and metabolic significance of the urea cycle in photosynthetic diatoms. Nature 473 : 203–209.
DOI: 10.1038/nature10074
Černotíková E., Horák A., Moravec F. (2011) Phylogenetic relationships of some spirurine nematodes (Nematoda: Chromadorea: Rhabditida: Spirurina) parasitic in fishes inferred from SSU rRNA gene sequences. Folia Parasitologica 58 : 135–148.


Dokumenty ke stažení:
2011_Cernotikova_FP_135 (pdf)
Saldarriaga J., Gile G., James E., Horák A., Scheffrahn R., Keeling P. (2011) Morphology and molecular phylogeny of Pseudotrichonympha hertwigi and Pseudotrichonympha paulistana (Trichonymphea, Parabasalia) from neotropical rhinotermitids. Journal of Eukaryotic Microbiology 58 : 487–496.
DOI: 10.1111/j.1550-7408.2011.00575.x
Janouškovec J., Horák A., Oborník M., Lukeš J., Keeling P. (2010) A common red algal origin of the apicomplexan, dinoflagellate, and heterokont plastids. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 107 : 10949–10954.
DOI: 10.1073/pnas.1003335107

Dokumenty ke stažení:
Janouskovec et al. 2010 PNAS (pdf)
Chroňáková A., Horák A., Elhottová D., Krištůfek V. (2009) Diverse archaeal community of a bat guano pile in Domica Cave (Slovak Karst, Slovakia). Folia Microbiologica 54 : 436–446.
DOI: 10.1007/s12223-009-0061-2

Více publikací

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Parazitologický ústav
Branišovská 1160/31
370 05 České Budějovice

NAJÍT PRACOVNÍKA