prof. Ing. Miroslav Oborník, Ph.D.

Funkce: Ředitel , Vedoucí laboratoře - Laboratoř evoluční protistologie

Kontaktní údaje

Telefon: Ředitelna: +420 38777 5480 / Laboratoř: +420 38777 5464
E-mail: obornik@paru.cas.cz
Místnost: Řed. 002/ Lab. 236

Popis

Řízení a vedení Parazitologického ústavu

Výzkumné zaměření - Evoluce prvoků a řas s nimi příbuzných.

 

Odborný životopis

Informace v anglické verzi.

Výuka Introduction to Bioinformatics
Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity / Faculty of Science, University of South Bohemia

Introduction to Bioinformatics exercises
Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity / Faculty of Science, University of South Bohemia

Molekulární taxonomie / Molecular Taxonomy
Zemědělská fakulta Jihočeské univerzity / Faculty of Agriculture, University of South Bohemia

Publikace
Celkem nalezeno: 112 záznamů
Darwish A.M., Sharaf A., Gaouar S.B.S., Ali N.I., El-Aziz T.H.A., Abshady A.M., Kaouadji Z., Othman O.E., Oborník M. (2023) Biochemical and genotyping analyses of camels (Cameus dromedaries) trypanosomiasis in North Africa Scientific Reports 13 : 7176.
DOI: 10.1038/s41598-023-34086-y
Lampe R.H., Coale T.H., Forsch K.O., Jabre L.J., Kekuewa S., Bertrand E.M., Horák A., Oborník M., Rabines A.J., Rowland E., Zheng H., Andersson A.J., Barbeau K.A., Allen A.E. (2023) Short-term acidification promotes diverse iron acquisition and conservation mechanisms in upwelling-associated phytoplankton Nature Communications 14 : 7215.
DOI: 10.1038/s41467-023-42949-1
Richtová J., Bazalová O., Horák A., Tomčala A., Gonepogu V., Oborník M., Doležel D. (2023) Circadian rhythms and circadian clock gene homologs of complex alga Chromera velia Frontiers in Plant Science 14 : 1226027.
DOI: 10.3389/fpls.2023.1226027
Jirků M., Kašparová A., Lhotská Z., Oborník M., Brožová K., Petrželková K. J., Samaš P., Kadlecová O., Stensvold C., Jirků-Pomajbíková K. (2022) A cross-sectional study on the occurrence of the intestinal protist, Dientamoeba fragilis, in the gut-gealthy volunteers and their animals International Journal of Molecular Sciences 22 : 15407.
DOI: 10.3390/ijms232315407
Kořený L., Oborník M., Horáková E., Waller R., Lukeš J. (2022) The convoluted history of haem biosynthesis Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society 97 : 141–162.
DOI: 10.1111/brv.1279

Dokumenty ke stažení:
Koreny_2022_Biol-Reviews (pdf)
Oborník M. (2022) Organellar Evolution: A Path from Benefit to Dependence Microorganisms 10 : 122.
DOI: 10.3390/microorganisms10010122
Pilátová J., Pánek T., Oborník M., Čepička I., Mojzeš P. (2022) Revisiting biocrystallization: purine crystalline inclusions are widespread in eukaryotes. ISME Journal 16 : 2290-2294.
DOI: 10.1038/s41396-022-01264-1
Sharaf A., Vijayanathan M., Oborník M., Mozgová I. (2022) Phylogenetic profiling resolves early emergence of PRC2 and illuminates its functional core Life Science Alliance 5 : e202101271.
DOI: 10.26508/lsa.202101271
Oborník M. (2021) Enigmatic Evolutionary History of Porphobilinogen Deaminase in Eukaryotic Phototrophs Biology-Basel 10 : 386.
DOI: 10.3390/biology10050386
Oborník M., Dorrell R.G., Tikhonenkov D.V. (2021) Editorial: Mixotrophic, Secondary Heterotrophic, and Parasitic Algae Frontiers in Plant Science 12 : 798555.
DOI: 10.3389/fpls.2021.798555
Oborník M., Füssy Z. (2021) Evolutionary and Molecular Aspects of Plastid Endosymbioses Biomolecules 11 : 1694.
DOI: 10.3390/biom11111694
Richtová J., Sheiner L., Gruber A., Yang S., Striepen B., Kořený L., Oborník M. (2021) Using Diatom and Apicomplexan Model to Study the Heme Pathway of Chromera velia International Journal of Molecular Sciences 22 : 6495.
DOI: 10.3390/ijms22126495
Tortorelli G., Pettolino F., Lai D., Tomčala A., Bacic A., Oborník M., Lukeš J., McFadden J.I. (2021) The cell wall polysacharides of a photosynthetic relative of apicomplexans, Chromera velia Journal of Phycology 57 : 1805-1809.
DOI: 10.1111/jpy.13211

Dokumenty ke stažení:
Tortorelli_2021_JPhyl (pdf)
Turnšek J., Brunson J.K., Viedma M.D.P.M., Deerinck T.J., Horák A., Oborník M., Bielinski V.A., Allen A.E. (2021) Proximity proteomics in a marine diatom reveals a putative cell surface-to-chloroplast iron trafficking pathway eLife 10 : e52770.
DOI: 10.7554/eLife.52770
Füssy Z., Záhonová K., Tomčala A., Krajčovič J., Yurchenko V., Oborník M., Eliáš M. (2020) The Cryptic Plastid of Euglena longa Defines a New Type of Nonphotosynthetic Plastid Organelle mSphere 5 : e00675-20.
DOI: 10.1128/mSphere.00675-20

Dokumenty ke stažení:
Fussy_2020_mSphere (pdf)
Gruber A., McKay C., Rocap G., Oborník M. (2020) Comparison of different versions of SignalP and TargetP for diatom plastid protein predictions with ASAFind Matters_ISSN_2297-8240 2020 : e202005000001.


Dokumenty ke stažení:
Gruber_2020_Matters (pdf)
Horák A., Allen A.E., Oborník M. (2020) Common origin of ornithine–urea cycle in opisthokonts and stramenopiles Scientific Reports 10 : 16687.
DOI: 10.1038/s41598-020-73715-8
Oborník M. (2020) Photoparasitism as an Intermediate State in theEvolution of Apicomplexan Parasites Trends in Parasitology 36 : 727-734.
DOI: 10.1016/j.pt.2020.06.002
Sato S., Nanjappa D., Dorrell R.G., Vieira F.R.J., Kazamia E., Tirichine L., Veluchamy A., Heilig R., Aury J.M., Jaillon O., Wincker P., Füssy Z., Oborník M., Muñoz-Gómez S.A., Mann D., Bowler C., Zingone A. (2020) Genome-enabled Phylogenetic and Functional Reconstruction of an Araphid Pennate Diatom Plagiostriata Sp. CCMP470, Previously Assigned as a Radial Centric Diatom, and Its Bacterial Commensal Scientific Reports 10 : 9449.
DOI: 10.1038/s41598-020-65941-x
Tomčala A., Michálek J., Schneedorferová I., Füssy Z., Gruber A., Vancová M., Oborník M. (2020) Fatty Acid Biosynthesis in Chromerids Biomolecules 10 : 1102.
DOI: 10.3390/biom10081102

Více publikací

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Parazitologický ústav
Branišovská 1160/31
370 05 České Budějovice

NAJÍT PRACOVNÍKA