Parazitologický ústav je součástí Biologického centra AV ČR, v. v. i. Provádí se zde základní výzkum parazitů člověka a zvířat na úrovni molekul, buněk i celých organismů. Posláním ústavu je získávat, prohlubovat a šířit znalost biologie a ekologie parazitických prvoků a eukaryotických mikroorganismů, helmintů a členovců. Ústav provádí nejen výzkum, ale také vzdělávání na národní i mezinárodní úrovni.