RNDr. Jan Kamiš

Funkce: Ph.D. student - Laboratoř arbovirologie

Kontaktní údaje

Telefon: +420 38 777 5463
E-mail: jan.kamis@paru.cas.cz
Web: https://klistatavemeste.vsb.cz/
Místnost: 324

Popis

V Laboratoři arbovirologie se věnuji eko-epidemiologii patogenů, které jsou přenášené klíšťaty, komáry či obratlovci a jsou schopné infikovat člověka. Cílem mého výzkumu jsou zejména viry z čeledi Flaviviridae, jako je virus klíšťové encefalitidy, virus Usutu, virus West Nile, virus Dengue a virus Alongshan, dále také viry skupiny Kemerovo (virus Lipovník/Tribeč) a orthohantaviry přenášené hlodavci a hmyzožravci. Zaměřuji se také na výzkum klíšťaty přenášených bakterií z rodů Borrelia, Anaplasma, Neoehrlichia a Rickettsia, které jsou součástí výzkumného projektu Klíšťata ve městě: https://klistatavemeste.vsb.cz/

V laboratoři se specializuji na sterilní práci s infekčními agens v podmínkách BSL2 a BSL3. Zaměřuji se na detekci virů a bakterií, od zpracování primárního vzorku (pitvy, homogenizace, izolace nukleových kyselin, automatizovaná izolace), přes screeningové metody molekulární biologie a virologické metody (PCR, multiplexová qPCR, RT-PCR, elektroforéza, plaková titrace, virus neutralizační test, imunofluorescence, izolace virů na buněčných kulturách…), až po identifikaci patogenů (Sangerovo sekvenování, WGS) a interpretaci fylogenetických vztahů. Není mi cizí ani práce s tkáňovými kulturami, plasmidy, a také se angažuji v laboratoři BSL3, kde pracuji s viry (SARS-CoV-2, virus West Nile, virus Dengue...) a myšími modely. V laboratoři také zajišťuji školení o bezpečnosti a ochraně zdraví při práci, školení o pravidlech při práci s infekčním materiálem a GMO v BSL2 a BSL3 podmínkách, a jsem obědový referent laboratoře.

Odborný životopis

Vzdělání:

Bakalářské studium (2016 – 2020)

• Studijní program: Biologie
• Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
• Téma bakalářské práce: Fylogenetické vztahy kokcidií parazitujících u myšice temnopásé (Apodemus agrarius) na základě sekvencí COX3 genu

Magisterské studium (2020 – 2022)

• Studijní program: Parazitologie
• Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
• Téma magisterské práce: Hlodavci jako rezervoár hantavirů

Rigorózní řízení (10/2022)

• Obor: Parazitologie
• Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
• Téma rigorózní práce: Orthohantaviruses in the reservoir and atypical hosts in the Czech Republic: spillover infection and indication of virus-specific tissue tropism

Doktorské studium (2023 - dosud)

• Studijní program: Parazitologie
• Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
• Téma: Ecoepidemiology of recognized and potential zoonotic pathogens of human

 

Účast na konferencích:

XXVII. Celostátní konference virologů, Hradecké virologické dny, 10. - 11. 9. 2025, Nové Adalbertinum, Hradec Králové

• Přednáška - Flaviviry u klíšťat a pacientů České republiky

16th International Symposium on Ticks and Tick-borne Diseases (ISTTBD-XVI), 26. - 28. 3. 2025, Weimar, Německo

• Přednáška - Tick-borne viral pathogens in ticks and human patients from the Czech Republic

31. Pečenkovy epidemiologické dny, 11. - 13. 9. 2024, Plzeň

• Přednáška - Klíšťata ve městě – kde číhá riziko bakteriální nákazy?

XXVI. Celostátní konference virologů, Hradecké virologické dny, 28. - 29. 5. 2024, Nové Adalbertinum, Hradec Králové

• Přednáška - Klíšťaty přenášené virové patogeny u klíšťat a pacientů v Jihočeském kraji

CzechoSlovak Virology Conference, 15. - 16. 2. 2024, Česká zemědělská univerzita, Praha

• Poster - Tick-borne encephalitis virus in patients and in ticks from natural endemic sites in South Bohemia

XXV. Celostátní konference virologů, Hradecké virologické dny, 17. - 18. 10. 2023, Nové Adalbertinum, Hradec Králové

• Přednáška - Virus klíšťové encefalitidy u pacientů a klíšťat v Jihočeském kraji

National Institute of Virology and Bacteriology (NIVB) meeting, 2. - 5. 10. 2023, Kutná Hora

• Poster - Tick-borne encephalitis virus in patients and in ticks from natural endemic sites in South Bohemia

The 2nd French – Czech Tick Meeting (FCTM2), 25. - 26. 9. 2023, Biologické centrum AV ČR, České Budějovice

• Přednáška - Tick-borne bacterial diseases in urban environments - where does the real danger lurk?

XXIV. Celostátní konference virologů, Hradecké virologické dny, 4. - 5. 10. 2022, Nové Adalbertinum, Hradec Králové

• Přednáška - Orthohantaviry v rezervoárových a atypických hostitelích v ČR

• Poster - Hantaviry v rezervoárových a atypických hostitelích na urbánních lokalitách České republiky - hostitelská specifita a tkáňový tropismus

Přednášky pro veřejnost:

Akademické půlhodinky 2025, 29.10.2025, Alšova Jihočeská galerie

• Přednáška - Mýty a fakta o klíšťatech (+ projekt Klíšťata ve městě, aplikace Klíšťapka)

Noc vědců 2025, 26.9.2025, České Budějovice, Biologické centrum AV ČR

• Rozhovor s moderátorem - projekt Klíšťata ve městě

Akademické půlhodinky 2024, 13.11.2024, Alšova Jihočeská galerie

• Přednáška - Klíšťata ve Stromovce – kde číhá skutečné riziko nákazy?

 

Vzdělávací akce pro veřejnost:

• Den lesů nové generace, 18.10.2025, Tábor - Mobilní laboratoř, projekt Klíšťata ve městě, Klíšťapka
• Noc vědců 2025, 26.9.2025, České Budějovice, Biologické centrum AV ČR, projekt Klíšťata ve městě
• Země živitelka 2025, 21.8.2025, České Budějovice - Mobilní laboratoř, projekt Klíšťata ve městě
• Mezinárodní setkání 25 let geocachingu, 3.5.2025, Praha, Žluté lázně - Mobilní laboratoř, projekt Klíšťata ve městě, Klíšťapka
• Den lesů nové generace, 5.10.2024, Hluboká nad Vltavou - Mobilní laboratoř, Aplikace Klíšťapka – pro předpověď aktivity klíšťat a nákazy
• Den za obnovu lesa, 23.9.2023, Ševětín - Vše o klíšťatech a Klíšťapce

 

 

 

Publikace